Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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