Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms