Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms