Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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