Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms