Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calb1P12658 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb1P12658 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms