Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp1P11103 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms