Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms