Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl2P10148 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms