Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnfP06804 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnfP06804 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TnfP06804 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms