Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01648 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01648 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01648 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01648 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01648 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01648 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms