Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms