Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms