Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dync1i1O88485 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dync1i1O88485 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms