Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10509O88255 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10509O88255 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10509O88255 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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