Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp4O70480 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms