Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BckdkO55028 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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