Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FxnO35943 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FxnO35943 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FxnO35943 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FxnO35943 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FxnO35943 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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