Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pik3cdO35904 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pik3cdO35904 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms