Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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