Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pld3O35405 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pld3O35405 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pld3O35405 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pld3O35405 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pld3O35405 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Pld3O35405 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pld3O35405 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms