Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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