Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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