Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm2056J3QQ02 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm2056J3QQ02 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2056J3QQ02 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2056J3QQ02 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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