Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2035J3QP87 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms