Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3415J3QMS8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3415J3QMS8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3415J3QMS8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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