Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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