Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms