Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms