Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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