Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Taf4bG5E8Z2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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