Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4cG3UXD1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4cG3UXD1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms