Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-1G3UXB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms