Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms