Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate1E9Q658 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms