Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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