Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms