Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddx60E9PZQ1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms