Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms