Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms