Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sfta2E9PXB6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms