Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim12cD3Z3L3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms