Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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