Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms