Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc8B2RUS7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms