Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud7bB2RUR8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms