Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms