Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf1B2RRD7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms