Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms