Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint7A7XV04 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint7A7XV04 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint7A7XV04 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint7A7XV04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms